农民工鉴定工伤的部门是当地的劳动保障行政部门。农民工首先需向用人单位所在地的劳动保障行政部门提出工伤认定申请,提交相关材料如工伤认定申请表、劳动关系证明等。劳动保障行政部门在接到申请后,会进行调查核实并作出工伤认定决定。如有异议,可依法申请行政复议或提起行政诉讼。
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